Tekeningen op de muren, een verdwenen koster, vreemde vondsten in de kerk. Om dit te verklaren vragen de nieuwe bewoners van de kosterswoning hulp aan bibliothecaresse Ilona Wachters. Tot groot ongenoegen van rechercheur Alex van den Burg gaat Ilona als een ware Miss Marple zelf op onderzoek uit. Kan de gepensioneerde pastoor haar meer vertellen over het verleden van de kerk? Waarom houdt de verwarde Christa in de gaten wat er rond de kerk gebeurt? Tijdens haar zoektocht duikt Ilona’s ex op. Is de drang om achter de waarheid te komen groter dan haar angst voor een confrontatie? “Mysterie in de kerk” is het derde deel in de Ilona Wachters serie waarin Ilona de toedracht van misdrijven of de waarheid achter mysteries op haar eigen wijze boven water haalt.